1、化肥的养分单一，含量高，肥效快，但延续时间短；有机肥养分齐全，肥效悠长，可改良泥土，培肥地力。二者混用，可舍短取长，全面供给作物生长所需养分，增进作物茁壮生长，提高增产效益。

2、化肥溶解快，溶解度大，施入泥土后，泥土溶液浓度一时会很快增高，造成作较高的浸透压，影响作物对养分和水分的吸收，增长了养分的散失和机会。有机肥和化肥混杂使用，能够抑制泥土溶液陡然增高的弊病，同时，有机肥能够改良作物对养分的吸收条件，提高泥土蓄水保肥能力，避免和减少化肥养分的散失，提高化肥利用率。

3、化肥施入泥土后，有些养分会被泥土吸收，鳌合或固定，下降肥效。如过磷酸钙和钙镁磷肥直接施入泥土，容易同泥土中的铁、铝、钙等元素联结，生成难溶性的磷酸物而被固定，造成有效养分丧失。若与有机肥混杂施用，不仅可减少与泥土接触面，减少泥土与化肥的固定机会，而且可使磷肥中那些难溶性的磷转化成作物能利用的有效磷，提高磷肥的肥效。

4、长期单施化肥会被损坏泥土的团粒结构，造成泥土粘重板结，下降耕作性能和供肥性能。有机肥含有丰盛的有机质，可活化蓬松泥土，下降容量；可改良泥土的水、肥、气、热等理化性状；调节酸碱度。二者混用，既可提高产量，又可增进农业的可延续性发展。