1、羊肉

南瓜子和羊肉都属于热性的食物，相结合会产生腹胀、便秘的可能性。尤其是患感染性疾病和发热症状者更不能食用，以免导致病情恶化。

2、咖啡

南瓜子的含铁量丰富，铁与维生素C是互相关联的，可是跟咖啡却是相克的，因此在吃南瓜籽等含铁丰富的食物时，不宜同时喝咖啡或喝茶，否则会影响铁质的吸收。

3、富含鞣酸的食物

南瓜子中含有丰富的蛋白质，若是和一些富含鞣酸的食物同吃，其蛋白质和鞣酸会发生络合反应，导致南瓜子的营养成分降低，还会加重消化负担。